Вынесение государственным органом решения в отношении филиала противоречит требованиям закона, так как нарушена процедура привлечения юридического лица к ответственности, что является основанием для признания акта государственного органа недействительным.

По обязательствам филиала обязанным является само юридическое лицо, поскольку доказан факт выполнения работ по договорам, заключённым с его филиалом.

Филиалом является обособленное подразделение юридического лица, расположенное вне места его нахождения и осуществляющее всего функции или их часть, в том числе функции представительства, то есть налог, уплаченный филиалом учреждения, необходимо расценивать как налог, уплаченный самим учреждением.

Действия филиала юридического лица, совершённые даже от своего имени, влекут возникновение соответствующих прав и обязанностей у самого юридического лица, поскольку филиал юридического лица не является юридическим лицом и выполняет функции представительства юридического лица.